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| Estándares y protocolos para la gestión de información sobre biodiversidad en el marco del SiB | |||||
| El Sistema de Información sobre Biodiversidad
de Colombia (SiB) facilita el intercambio de información biológica
de alta calidad a través de Internet. Para que la información
sea verdaderamente intercambiable y útil para diferentes personas
en distintos momento y con múltiples propósitos, es necesario
llegar a acuerdos mínimos sobre cómo esa información
se describe, se almacena y se comparte, o se transmite. Estos acuerdos son
los estándares y los protocolos.
Formalmente, un estándar es un patrón o referencia para la unificación de información y del formato en el cual esta información es consignada, registra o intercambiada. Por su parte, un protocolo es el conjunto de acuerdos y procedimientos concertados para llevar a cabo una actividad o concretar un producto; un estándar puede ser una parte del protocolo. Para poder gestionar apropiadamente la información en el marco del SiB se han desarrollado estándares para identificar (metadatos), ordenar o describir (registros biológicos, archivos de autoridad taxonómica) y compartir la información (intercambio) (Figura 1). Además, el SiB ha adoptado estándares internacionales de amplio uso como Plinian Core y Darwin Core para intercambiar información de especies y especimenes, respectivamente. A continuación se hace una reseña de cada uno de los estándares producidos por el SiB.
Estándar para la documentación de metadatos de conjuntos de datos relacionados con biodiversidad Rivera-Gutiérrez H. F. & Suárez-Mayorga A.M. 2005.
Estándar para la documentación de metadatos de conjuntos
de datos relacionados con biodiversidad. Sistema de Información
sobre Biodiversidad de Colombia. Instituto de Investigación de
Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, Bogotá, Colombia,
56 p. El propósito de este documento es facilitar la descripción apropiada, y en un formato estandarizado, de la información contenida en cualquier conjunto de datos relacionado con biodiversidad. Por tratarse de un documento analítico que compara e integra varias de las guías y estándares disponibles en el mundo para la documentación de metadatos (FGDC V2, NBN V 2003, Dublin Core, entre otros), se constituye en una propuesta robusta para la documentación de conjuntos de datos en el ámbito internacional, a la vez que facilita evaluar el potencial de uso de la información disponible y garantiza el reconocimiento de las autorías y las condiciones de acceso y uso relativas a cada conjunto de datos. Así mismo, en la escala nacional representa la primera forma en la que un administrador de información da a conocer sus conjuntos de datos en el marco del SIB, sin necesariamente proporcionar acceso a los datos propiamente dichos. Actualmente este estándar sirve de base en Colombia para la documentación de metadatos en el Catálogo nacional de metadatos relacionados con biodiversidad y ha sido empleado en la construcción de cerca de 2500 metadatos, los cuales se encuentran disponibles en línea a través del Portal interinstitucional SIB (www.siac.net.ci/sib/metadatos). Estándar para la documentación de registros biológicos A través de este estándar el Equipo Coordinador del SIB propone una estructura conceptual para capturar y almacenar información sobre cualquier unidad biológica (genes, organismos, ecosistemas) en un formato común e interoperable. Esta estructura puede ser utilizada en la medida en que a) la unidad biológica esté referida a un lugar y, usualmente, a un momento o lapso determinado; b) que pueda ser descrita mediante sus características o atributos, y c) que sean conocidos los métodos bajo los cuales se hace el registro o a partir de los cuales se evalúan los atributos definidos para dicha unidad biológica. Por ello, el estándar contiene los parámetros obligatorios (mínimos), óptimos y opcionales que deben tenerse en cuenta para describir la unidad biológica de una forma comprehensiva e interoperable, coherente con otros estándares para documentación de información biológica disponibles en el mundo (p. ej. ABCD Schema, NBII-Biological data profile). Aunque el estándar no representa una estructura física de almacenamiento, a partir de él se han desarrollado en Colombia herramientas informáticas y conjuntos de datos digitales que cumplen con sus requisitos de completitud y compatibilidad, como la Aplicación de registros biológicos del SIB (disponible en línea en la sección de “Registros biológicos” de http://www.siac.net.co/sib_descargas.php). Estándar para intercambiar información sobre biodiversidad al nivel de organismos Suárez-Mayorga A.M., Bernal R. & Cárdenas López
D. 2005. Estándar para intercambiar información al nivel
de organismos. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos
Alexander von Humboldt, Bogotá, Colombia, 26 p. Este estándar representa el primer acuerdo entre los miembros del Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SIB) respecto a la información que es imprescindible poner a disposición a través de Internet cuando se describe la presencia de organismos en un lugar determinado, bien sea que éstos formen parte de una colección biológica o que hayan sido registrados por cualquier medio (observaciones, grabaciones, imágenes, etc.). A diferencia del Estándar para la documentación de registros biológicos, este estándar no regula la forma en la que se captura la información, sino los contenidos que es necesario compartir para poder integrar la información proveniente de cualesquiera estructuras de datos con las que cuenten los aportantes de información en el sistema y por lo mismo, debe ser compatible con otros estándares desarrollados para tal fin en el mundo, como Darwin Core (versiones 2 y 1.4). Estándar para la elaboración de archivos de autoridad
taxonómica El documento que aquí se presenta define y explica los elementos mínimos necesarios para la construcción de un vocabulario taxonómico controlado, que esté acorde con los catálogos taxonómicos que se han generado en el mundo y que facilite a los administradores de datos sobre biodiversidad la depuración y validación taxonómica de sus conjuntos de datos. Con base en este estándar se ha desarrollado en el marco del SIB una serie de Archivos de autoridad taxonómica (AAT) para grupos prioritarios de organismos, los cuales se encuentran disponibles en línea –y descargables—en http://www.siac.net.co/sib/aat/WebModuleAAT/index.jsp y una aplicación para la documentación de AAT que incorpora, entre otros, la posibilidad de hacer equivalencias entre diferentes sistemas de clasificación. Para mayor información sobre esta herramienta o cualquier otra,
visite la sección de descargas del Portal Interinstitucional SIB
(www.siac.net.co/sib). |
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