Desde sus inicios, el Instituto Humboldt ha adelantado acciones relacionadas con el manejo de información sobre biodiversidad, principalmente en relación con la sistematización de las colecciones biológicas. Desde 1997 hasta 1999, buena parte del trabajo se centró en el desarrollo de bases de datos y aplicaciones. Andigena, Arkas y Araneus fueron los principales proyectos realizados durante ese período (ver Hechos y momentos).
Paralelamente, y en el marco del proyecto Atlas de la Biodiversidad de Colombia (proyecto ABC), se empezó a trabajar en el diseño de un sistema de información sobre biodiversidad que soportara el desarrollo de productos de información como el Catálogo en línea de la biota colombiana. Durante este período (comprendido entre 1998 y finales de 2000), fue muy importante la participación del Instituto Humboldt, en especial del proyecto ABC, en las reuniones de la Red Interamericana de Información sobre Biodiversidad (IABIN), espacio que permitió conocer de cerca las principales iniciativas nacionales, regionales y globales en materia de sistemas y redes de información sobre biodiversidad.
Si bien en esta fase se dieron logros conceptuales importantes para el diseño del SIB, se avanzó poco en su implementación dada la limitación de recursos. Posteriormente, el proyecto ABC participó en el diseño del proyecto Andes, aspecto que consolidó la inclusión de un subcomponente para el desarrollo de un sistema descentralizado de información sobre la biodiversidad andina. La fase actual del SIB inició junto con el proyecto Andes, en agosto de 2001; esta fase ha incluido la conformación del Equipo Coordinador del SIB, la propuesta e implementación de una arquitectura distribuida para el funcionamiento del SIB, la formulación de políticas para la gestión de información, la adopción de estándares y protocolos, la conformación de conjuntos de datos distribuidos y de referencia, y la definición de actores involucrados en la implementación del Sistema, como el Comité Técnico Directivo y las redes regionales y temáticas de administradores de información sobre biodiversidad.
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